海兰鸡内源性白血病病毒位点序列鉴定与分析

doi:10.11843/j.issn.0366-6964.2015.11.018

畜牧兽医学报 ›› 2015, Vol. 46 ›› Issue (11): 2050-2055.doi: 10.11843/j.issn.0366-6964.2015.11.018

海兰鸡内源性白血病病毒位点序列鉴定与分析

陈孜孟^1，2#，董宣^1#，苏帅¹，崔宁¹，李卓^2*，崔治中^1*

（1.山东农业大学动物医学院，泰安 271018；2.国家海洋局第三海洋研究所，厦门 361005）

收稿日期:2015-03-27 出版日期:2015-11-23 发布日期:2015-11-23
通讯作者: 崔治中，博士生导师，E-mail：zzcui@sdau.edu.cn；李卓
作者简介:陈孜孟（1987-），男，山东寿光人，硕士生，主要从事动物分子病毒学方面研究，E-mail：769623544@qq.com；董宣（1988-），男，山东胶南人，博士生，主要从事动物分子病毒学方面研究，E-mail：dongxuan311@163.com。二人共为第一作者
基金资助:
公益性行业（农业）科研专项（201203055）

Identification and Sequence Analysis of Endogenous Avian Leukosis Virus Element in Genome of Hy-Line Brown Layers

CHEN Zi-meng^1，2# ，DONG Xuan^1# ，SU Shuai¹，CUI Ning¹，LI Zhuo^2* ，CUI Zhi-zhong^1*

（1.College of Veterinary Medicine，Shandong Agricultural University，Tai’an 271018，China；2.Third Institute of Oceanography，State Oceanic Administration，Xiamen 361005，China）

Received:2015-03-27 Online:2015-11-23 Published:2015-11-23

摘要/Abstract

摘要：

鉴定和比较海兰鸡基因组中内源性禽白血病病毒（ALV）位点。使用超嗜热古菌Thermococcus sp.4557来源重组表达的Pol B DNA聚合酶，通过一次PCR反应从海兰鸡的基因组DNA中扩增到了包括gag、pol、env基因部分片段及3′-LTR的内源性ALV位点，将其命名为HL-E1。序列比较表明，其env基因与E亚群内源性ALV高度同源；与完整的ALV基因组相比，其gag、pol、env三个主要功能基因分别缺失了93、1 960和805个碱基。海兰鸡基因组中存在4 663 bp的缺陷型ALV基因组片段，其env基因和LTR都与鸡基因组上经典的ev1位点的相应基因有96.8%和97.4%的相似性，表明这是整合进海兰鸡染色体基因组中的一个内源性E亚群ALV片段构成的ev位点，这是又一个ev位点的全序列报道。

Abstract:

To study the integration site of endogenous avian leukosis virus（ALV） elements in the genome of Hy-Line Variety Brown，a non-joined PCR amplicon（named HL-E1） was obtained using a B family DNA polymerase from hypothermophilic archaea Thermococcus sp.4557（TXW-PolB）.HL-E1 contains three essential genes including gag，pol，and env and the 3’-LTRs.And it lacks 93，1 960 and 805 base pairs in the gag，pol and env genes，respectively.A 4 663 bp functional mutant of ALV integrated in the Hy-Line Variety Brown genome.The conserved env（highly similar with endogenous avian leucosis virus） and LTR genes have identities of 96.8% and 97.4% to ev1 site.This indicates a newly identified endogenous ALV sequence integrated in an unknown site in the chicken genome.

中图分类号:

S852.659.3

陈孜孟，董宣，苏帅，崔宁，李卓，崔治中. 海兰鸡内源性白血病病毒位点序列鉴定与分析[J]. 畜牧兽医学报, 2015, 46(11): 2050-2055.

CHEN Zi-meng，DONG Xuan，SU Shuai，CUI Ning，LI Zhuo，CUI Zhi-zhong. Identification and Sequence Analysis of Endogenous Avian Leukosis Virus Element in Genome of Hy-Line Brown Layers[J]. ACTA VETERINARIA ET ZOOTECHNICA SINICA, 2015, 46(11): 2050-2055.

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海兰鸡内源性白血病病毒位点序列鉴定与分析

Identification and Sequence Analysis of Endogenous Avian Leukosis Virus Element in Genome of Hy-Line Brown Layers

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